El agua termal con la cual se alimentan las piletas termales del complejo Termas del Guaychu fluye en forma natural desde las grandes profundidades de la tierra, calentada por el contacto con la roca base de la tierra y otras capas geológicas que se encuentran a 1000 ( mil) metros de la superficie terrestre.
El agua que alimenta las piletas de Termas de Guaychu es una agua congénita , que nunca salió a la superficie desde el periodo Jurásico, esta permanencia de casi 200 millones de años la ha transformado en un agua termo mineral con grandes contenidos de sólidos disueltos cuyas características fisco químicas la definen como un agua sódica con alta cloruracion y con contenidos de sulfatos, calcio y potasio, entre otros minerales, lo cual agrega a las condiciones relajantes que de por sí tienen las aguas termales, características terapéuticas.